Outils en 2021 de biologie des systèmes

Je veux ici faire une récapitulatif d’outils de modélisation, simulation et analyse de réseaux pour la biologie des systèmes en 2021.

Simulations de réseaux

XXPAUT

Historique. Valeur sûre ! Point fort analyse de bifurcation. Nécessite l’écriture explicite des modèles mathématiques.

Modèles à base déquations différentielles ordinaires

COPASI

Ici pour un exemple d’utilisation

Kappa

rule-based language for modeling interaction networks

https://kappalanguage.org/

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